首先，在設計時，首先要考慮模塊化潔凈室(無塵室)的用途，人員以及物料的運動路線，整體面積的大小，然后根據用途對空間進行合理的分割。風淋室、貨淋室、傳遞窗、門、玻璃等配套設施初步考慮需要的規(guī)格、材質，安裝位置，門口朝向等。

其次，根據模塊化潔凈室(無塵車間)的潔凈等級，進行風機濾網機組FFU布局，如果潔凈等級較高，還要采用高架地板。