與抵押、質(zhì)押的區(qū)別：抵押和質(zhì)押是物的擔保，需要以特定的財產(chǎn)作為擔保物；而保函是一種信用擔保，不需要提供具體的實物資產(chǎn)作為擔保，而是憑借擔保人的信用來承擔擔保責任。在實現(xiàn)擔保權(quán)益的方式上，抵押和質(zhì)押需要通過對擔保物進行處置來實現(xiàn)債權(quán)，而保函則是由擔保人直接向受益人支付款項來履行擔保義務。

合同約定：預付款保函是為保障基礎(chǔ)交易合同中預付款的而設(shè)立的，合同雙方可根據(jù)交易的具體安排和需求，在合同中約定預付款保函的期限。比如在大型設(shè)備采購合同中，雙方可根據(jù)設(shè)備生產(chǎn)周期、運輸時間等因素，協(xié)商確定預付款保函的期限。

從常見商業(yè)實踐看

在實際商業(yè)活動中，預付款保函期限超過預付款使用期限是較為常見的做法。一般會根據(jù)合同的整體期限、項目的復雜程度等因素來綜合確定保函期限。比如在一些大型設(shè)備采購項目中，預付款使用期限可能在設(shè)備生產(chǎn)階段，但保函期限通常會延長至設(shè)備交付后的一定質(zhì)保期內(nèi)，以保證在整個交易過程中受益人的權(quán)益都能得到有效保障。

從法律規(guī)定角度看

只要預付款保函期限的約定是在法律法規(guī)允許的范圍內(nèi)，且是合同雙方真實意思的表示，不存在欺詐、脅迫等違法違規(guī)情形，那么保函期限超過預付款使用期限是合法有效的，受到法律的保護。我國《民法典》等相關(guān)法律法規(guī)尊重當事人的意思自治，允許合同雙方根據(jù)實際情況協(xié)商確定保函期限等條款。