北京兒童醫(yī)院技術(shù)力量雄厚。擁有重點(diǎn)學(xué)科兒科學(xué)，國家兒童腫瘤監(jiān)測中心、國家呼吸系統(tǒng)疾病臨床醫(yī)學(xué)研究中心、國家中西醫(yī)協(xié)同旗艦醫(yī)院試點(diǎn)單位等12個(gè)平臺，8個(gè)國家臨床重點(diǎn)?？?，5個(gè)北京市重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，2個(gè)北京市級研究平臺以及16個(gè)市級醫(yī)療中心。醫(yī)院設(shè)有疑難罕見病例會診中心和遠(yuǎn)程會診中心，兒科疑難重癥疾病的診斷水平居國內(nèi)地位，是中華醫(yī)學(xué)會兒科學(xué)分會、兒外科分會，中國醫(yī)師協(xié)會小兒外科醫(yī)師分會，中華護(hù)理學(xué)會兒科專業(yè)委員會主任委員單位。

北京兒童醫(yī)院先后獲得“全國文明單位”“首都文明單位標(biāo)兵”“首都文明服務(wù)示范窗口”“專科醫(yī)院”“雙十佳人民滿意醫(yī)院”“北京蕞受歡迎三甲醫(yī)院”榮譽(yù)稱號及“首都勞動獎(jiǎng)狀”“全國五一勞動獎(jiǎng)狀”。

在國內(nèi)率先開展了兒童正常腦發(fā)育和神經(jīng)障礙性疾病的多模態(tài)磁共振研究,首次利用酰胺質(zhì)子轉(zhuǎn)移成像和磁化轉(zhuǎn)移成像技術(shù)發(fā)現(xiàn)兒童腦白質(zhì)的游離蛋白含量隨著腦發(fā)育進(jìn)程逐漸減低,提出APT成像技術(shù)可以用來監(jiān)測兒童的髓鞘化形成過程。2012年1月提出腦認(rèn)知功能癱瘓概念(認(rèn)知癱, Cognitive palsy, CP)，是繼Kanner之后對腦認(rèn)知的重大推進(jìn)。這是一個(gè)全新的精神病理學(xué)概念。目前正利用彌散張量磁共振成像技術(shù)建立0-2歲嬰幼兒腦白質(zhì)模板,以填充和彌補(bǔ)人類腦計(jì)劃中嬰幼兒腦發(fā)育的空白?

2019年1月由中國醫(yī)師協(xié)會和醫(yī)師報(bào)主辦的推動行業(yè)前行的力量——第四屆《醫(yī)師報(bào)》醫(yī)學(xué)家峰會推選國家兒童醫(yī)學(xué)中心首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京兒童醫(yī)院精神心理科榮獲2018年中國健康公益星十大公益醫(yī)院/科室獎(jiǎng)。