北京301醫(yī)院先后被評為“國際模范愛嬰醫(yī)院”、“全國百佳醫(yī)院”、“全國百姓放心醫(yī)院”、“全國百姓放心示范醫(yī)院”、“全軍為部隊服務先進醫(yī)院”，榮獲全國衛(wèi)生系統(tǒng)“文化建設創(chuàng)新獎”、國家衛(wèi)生部授予“醫(yī)院改革創(chuàng)新獎”。

北京301醫(yī)院擁有1個國家重點實驗室、2個教育部重點實驗室、9個北京市重點實驗室，12個全軍醫(yī)學專業(yè)重點實驗室，國家臨床醫(yī)學研究中心1個，國際聯(lián)合研究中心1個，形成了以綜合診療為特色的13項專業(yè)優(yōu)勢。

令狐恩強提出的診斷與治 療一體的LDRf分型記錄法，是全世界首 個覆蓋全消化道的靜脈曲張分型記錄法，在全國使用；提出的肝移植術后ERCP膽管狹窄的A/B/C/D 分型法對膽管狹窄的治 療具有一定的指導意義；提出的賁門失弛緩內鏡下I/II/III分型法、與黏膜粘連度a/b/c/d/e/f分級法填補了國際空白，為消化內鏡隧道技術的適應證與禁忌癥的制定奠定了基礎。

令狐恩強為中國逆行胰膽管造影（ERCP）規(guī)范的出臺做出了積極的貢獻，為中國消化道早癌的內鏡下技術的完善與普及做了大量工作，為中國的內鏡下早癌切除躋身世界先進行列做出了積極的貢獻。