1996年，茅臺酒工藝被確定為國家機密加以保護。2001年，茅臺酒傳統(tǒng)工藝列入首批物質文化遺產。2006年，批準將“茅臺酒傳統(tǒng)釀造工藝”列入首批非物質文化遺產名錄，并申報世界非物質文化遺產。2001年3月29日，茅臺酒被批準為“原產地域保護產品”。2013年3月28日，原國家質檢總局批準調整“茅臺酒”地理標志產品保護名稱和保護范圍。

在此期間，要經歷重陽下沙、端午踩曲、長期貯存等工藝環(huán)節(jié)的淬煉，制酒生產一年一個生產周期，順應季節(jié)變換，歷經兩次投料、九次蒸煮、八次發(fā)酵、七次取酒；釀制而成的基酒還需在陶壇中經過三年以上的貯存，后，采用酒勾酒的方式將一百余種不同酒齡、不同香型、不同輪次、不同酒度等各有特色的基酒進行組合，形成了茅臺酒的典型風格。

茅臺酒工藝中的三長主要指茅臺酒基酒生產周期長；大曲貯存時間長；茅臺酒基酒酒齡長。茅臺酒基酒生產周期長達一年，須二次投料、九次蒸餾、八次發(fā)酵、七次取酒，歷經春、夏、秋、冬一年時間。而其它名白酒只需幾個月或十多天即可。茅臺酒大曲貯存時間長達6個月才能流入制曲生產使用，比其它白酒多存3－4個月，這對提高茅臺酒基酒質量具有重要作用，而且大曲用量大，是其它白酒的4－5倍。茅臺酒一般需要長達三年以上貯存才能勾兌，通過貯存可趨利避害，使酒體更醇香味美，加上茅臺酒高沸點物質豐富，更能體現(xiàn)茅臺酒的價值，這是其它香型白酒不具有的特點。

專用標志使用

茅臺酒（貴州茅臺酒）產地范圍內的生產者，可向貴州省質量技術監(jiān)督局提出使用“地理標志產品專用標志”的申請，經貴州省質量技術監(jiān)督局審核，報質檢總局核準后予以公告。茅臺酒（貴州茅臺酒）的法定檢測機構由貴州省質量技術監(jiān)督局負責指定。 [4]

2020年7月20日，茅臺酒（貴州茅臺酒）入選中歐地理標志首批保護清單。