北京兒童醫(yī)院設備先進、設施完善、技術力量雄厚，科室齊全，設有呼吸科、泌尿外科、重癥醫(yī)學科、血液腫瘤中心等35個臨床和醫(yī)技科室。醫(yī)院擁有國家呼吸系統(tǒng)疾病臨床醫(yī)學研究中心，兒科重癥、小兒呼吸、中西醫(yī)結合兒科、小兒外科和臨床護理等5個國家臨床重點?？平ㄔO項目，還擁有兒童白血病分子分型、小兒耳鼻咽喉頭頸外科、兒科呼吸感染等3個北京市重點實驗室，北京市兒童外科矯形支具工程技術研究中心以及小兒先天性心臟病中心、小兒實體瘤中心、兒童睡眠疾病中心等1 6個市級醫(yī)療中心。在小兒復雜先心病的手術、各類脊柱畸形的矯正、小兒泌尿畸形矯正、腹胸腔鏡、急腹癥及創(chuàng)傷以及

神經、呼吸、內分泌、腎病、血液透析、耳鼻喉、纖維支氣管鏡、影像技術等專業(yè)疾病的診斷及診療設備居國內地位，并率先在國內將兒科就診年齡擴大到18歲。

尿道下裂是小兒泌尿生殖系統(tǒng)常見的畸形之一，占北京兒童醫(yī)院泌尿外科病房收治病人數(shù)量的1/3～1/2，每年住院手術1000人次以上，還不包括幾位知名專家外出會診手術的例數(shù)。北京兒童醫(yī)院泌尿外科團隊經過近50年、幾代人努力，在尿道下裂上積累了豐富經驗，在國內水平。是國內收治病人數(shù)量多的科室，尤其重度尿道下裂病例占很大比例。

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