醫(yī)院擁有教育部兒科學國家重點學科和教學團隊，是首都醫(yī)科大學兒科醫(yī)學院和兒科學系所在地，現有教授、副教授84人，博、碩士研究生導師64人，承擔著博士、碩士研究生、七年制兒科專業(yè)、護理大中專及繼續(xù)醫(yī)學教育等多層次教學任務，并設有博士后流動站，每年為社會輸送大量兒科人才。

多年來，為方便病人，北京兒童醫(yī)院始終堅持24小時接診病人，同時開設晚間門診。為繼續(xù)深入推動公立醫(yī)院醫(yī)療改革，醫(yī)院積極推進預約掛號工作，優(yōu)化服務流程，有針對性地解決了群眾反映突出的“看病難、住院難”問題，受到國家衛(wèi)計委的肯定和廣大群眾的認可。在完成日常醫(yī)療工作的同時，醫(yī)院還承擔了國家衛(wèi)計委、北京市衛(wèi)生局委派的手足口病防治、問題奶粉篩查、H7N9禽流感疫情篩查、抗震救災支援、突發(fā)公共事件救援等醫(yī)療救治任務。多年來，醫(yī)院以”以病人為中心，全心全意為兒童服務”為宗旨，大力弘揚“公慈勤和”院訓精神，樹立醫(yī)德醫(yī)風品牌，涌現出全國道德模范、“時代楷?！辟Z立群同志等杰出代表。

尿道下裂是小兒泌尿生殖系統(tǒng)常見的畸形之一，占北京兒童醫(yī)院泌尿外科病房收治病人數量的1/3～1/2，每年住院手術1000人次以上，還不包括幾位知名專家外出會診手術的例數。北京兒童醫(yī)院泌尿外科團隊經過近50年、幾代人努力，在尿道下裂上積累了豐富經驗，在國內水平。是國內收治病人數量多的科室，尤其重度尿道下裂病例占很大比例。

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