為了保證稅款及時、均衡入庫，在實際工作中，一般采取分月、分季預繳稅款，年終匯算清繳，多退少補的征收辦法。分月、分季預繳，一般按納稅人本季度 (月) 的課稅依據計算應納稅款，與全年決算的課稅依據往往很難完全一致，所以在年度終了后，必須依據納稅人的財務決算進行匯總計算，清繳稅款，對已預交的稅款實行多退少補。

納稅人申請年度匯算退稅，應當提供其在中國境內開設的符合條件的銀行賬戶。稅務機關按規(guī)定審核后，按照國庫管理有關規(guī)定，在本公告第九條確定的接受年度匯算申報的稅務機關所在地（即匯算清繳地）就地辦理稅款退庫。納稅人未提供本人有效銀行賬戶，或者提供的信息資料有誤的，稅務機關將通知納稅人更正，納稅人按要求更正后依法辦理退稅。

所得稅匯算清繳，其實就是上年度所得稅清算的一個過程。每年5月31日需向稅務機關提交。有一個專門匯算表格，根據會計準則和稅務規(guī)定，把該調整增加的增加，該減少的減少。

《中華人民共和國企業(yè)所得稅法》第五十四條規(guī)定：企業(yè)應當自年度終了之日起五個月內繳納企業(yè)所得稅申請表。

所得稅的納稅人以會計數據為基礎，將財務會計處理與稅收法律法規(guī)規(guī)定不一致的地方按照稅收法律法規(guī)的規(guī)定進行納稅調整，將會計所得調整為應納稅所得，套用適用稅率計算得出年度應納稅額，與年度內已預繳稅額相比較后的差額，確定應補或應退稅款，并在在稅法規(guī)定的申報期內向稅務機關提交會計決算報表和企業(yè)所得稅年度納稅申報表以及稅務機關要求報送的其他資料，經稅務機關審核后，辦理結清稅款手續(xù)。企業(yè)所得稅匯算清繳工作應以企業(yè)會計核算為基礎，以稅收法規(guī)為依據。