無菌實驗室設計的各項建筑物應堅固耐用、易于維修、易于清潔，并有能防止食品、食品接觸面及內(nèi)包裝材料遭受污染(如有害動物的侵入、棲息、繁殖等)的結(jié)構(gòu)。

為防止交叉污染，應分別設置人員通道及物料運輸通道，人員通道應按潔凈室通道要求（參考上圖）嚴格執(zhí)行，各通道應裝有空氣幕(即風幕)或雙向彈簧門及電子滅蠅(蚊)器等防蟲設施。

無菌工作區(qū)有用無菌操作臺，沒有的話也可以用潔凈工作臺代替。需要放置在離門遠的地方。

無菌實驗室設計的地面應使用、不滲水、不吸水、防滑、無裂隙且易于清洗的建筑材料鋪砌(如耐酸磚、水磨石、混凝土等)，地面應有適當坡度(以1.0~1.5%為宜)。

無菌實驗室墻壁與門窗

1、無菌實驗室的墻壁應采用、不吸水、不滲水、防霉、平滑、易清洗的淺色材料構(gòu)筑，用此材料裝修高度應直至屋頂。

2、所有門窗結(jié)構(gòu)應采用防銹、防潮、易清洗的密封框架。

無菌實驗室采光、照明設施

無菌實驗室應有充足的自然采光或人工照明，加工場所工作面的混合照度不應低于300lx，配料及灌裝車間不應低于800lx。