無菌室也稱接種室，是系統(tǒng)接種、純化菌種等無菌操作的專用實驗室。在微生物工作中，菌種的接種移植是一項主要操作，這項操作的特點就是要保證菌種純種，防止雜菌的污染。在一般環(huán)境的空氣中，由于存在許多塵埃和雜菌，很易造成污染，對接種工作干擾很大。

無菌工作區(qū)有用無菌操作臺，沒有的話也可以用潔凈工作臺代替。需要放置在離門遠的地方。

無菌實驗室設計的地面應使用、不滲水、不吸水、防滑、無裂隙且易于清洗的建筑材料鋪砌(如耐酸磚、水磨石、混凝土等)，地面應有適當坡度(以1.0~1.5%為宜)。

無菌實驗室應有充足的自然采光或人工照明，加工場所工作面的混合照度不應低于300lx，配料及灌裝車間不應低于800lx。

無菌實驗室空氣處理凈化設施

1、無菌實驗室必須安裝有效的通風設備，其空氣流向應從清潔區(qū)域流向非清潔區(qū)域，采用機械通風時，換氣量應大于3次/小時。

2、無菌實驗室溫度應控制在15~27℃之間，濕度以控制在50%以下為宜。

3、無菌實驗室入口處應分別設有人員和物料的凈化設施。

無菌實驗室專辟于微生物實驗室內(nèi)，室外室內(nèi)裝備的換氣設備必須有空氣過濾裝置。在獲得了無菌環(huán)境和無菌材料后，只有保持無菌狀態(tài)，才能對某種特定的已知微生物進行研究。所以控菌能力和控菌穩(wěn)定性是無菌室的核心驗收指標。業(yè)內(nèi)通行的驗收標準為100級潔凈區(qū)平板雜菌數(shù)平均不得超過1個菌落，10000級潔凈室平均不得超過3個菌落，在通行標準之外，還應該定期保養(yǎng)與維護。只有建設時合理的選材指標，合適凈化等級和長期管理與維護，才能使無菌實驗室發(fā)揮其應有的作用。