無菌室外要設(shè)一個緩沖間，錯開門向，以免氣流帶進雜菌。無菌室和緩沖間都必須密閉、室內(nèi)裝備的換氣設(shè)備必須有空氣過濾裝置。在獲得了無菌環(huán)境和無菌材料后，只有保持無菌狀態(tài)，才能對某種特定的已知微生物進行研究。

無菌定義是要求沒有活體微生物的存在，為了達到無菌車間內(nèi)沒有活體微生物，無菌車間在產(chǎn)品制造過程中需要采取各種方法來去除制品中原有的微生物和防止制品受到微生物的污染。那么，在無菌車間中，使空間內(nèi)達到無菌要求，就是室內(nèi)環(huán)境控制的重點。控制微生物的生長、殺滅或去除微生物的方法通常有兩種，一種為化學(xué)類，另一種為物理類。其中，化學(xué)方法有化學(xué)劑、氣化雙氧水、臭氧和環(huán)氧乙烷等；物理方法有濕熱或干熱、輻射和過濾等。

食品物料的分為熱力和冷菌。食品無塵無塵無菌包裝的物料到目前為止主要是熱力，其又分超高溫和高溫短時兩種，物料的冷方法 主要指紫外線和微波。超高溫是指在溫度和時間分別為135-150℃和2-8秒的條件下，對乳品或其他食品進行處理的一種工藝。由于它具有許多優(yōu) 點，特別是可以解決既能殺死產(chǎn)品中的微生物，又可較好的保持食品品質(zhì)與營養(yǎng)價值這對矛盾，現(xiàn)已廣泛應(yīng)用于牛乳、果汁及果汁飲料、豆乳、茶、酒、礦泉水及其 它產(chǎn)品的生產(chǎn)。

在獲得了無菌環(huán)境和無菌材料后，還要保持無菌狀態(tài)，才能對某種特定的已知微生物進行研究或利用它們的功能，否則外界的各種微生物很容易混入。外界不相干的微生物混入的現(xiàn)象，在微生物學(xué)中叫做污染雜菌。防止污染是微生物學(xué)工作中十分關(guān)鍵的技術(shù)。