萬級無菌室容積小而嚴密，使用一段時間后，室內溫度很高，故應設置通氣窗。通氣窗應設在內室進門處的頂棚上(即離工作臺zui遠的位置)，為雙層結構，外層為百葉窗，內層可用抽板式窗扇。通氣窗可在內室使用后、自凈前開啟，以流通空氣。有條件可安裝恒溫恒濕機。

萬級無菌室有足夠的存儲空間擺放物品以方便使用。在實驗室工作區(qū)域處還有供長期使用的存儲空間。在實驗室的工作區(qū)域處應有存放個人衣物的條件。在實驗室所有的建筑內配備高壓蒸汽自凈器，并按期檢查和驗證，以保證符合要求。

在實驗室內配備生物柜。設洗眼設施，必要時應有應急噴淋裝置。考慮機械通風，如使用窗戶自然通風，有防蟲紗窗。有可靠的電力供應和應急照明。必要時，重要設備如培養(yǎng)箱、生物柜、冰箱等應設備用電源。實驗室出口有在黑暗是可明確辨認的標識。

為實驗室用戶設計凈化工程方案時，采用工業(yè)化、標準化的運作理念，將多年的凈化工程項目進行歸納整理，就是將復雜的實驗室凈化工程項目進行模塊化，便于恰當的根據用戶的不同情況和特點以及需求，進行了更優(yōu)化的組合。在提供的方案中采用因地制宜的做法，把建筑裝修、配電、空調、消防全都做成標準化的方案，制定具有針對性的方案設計。