種子的大小形狀，顏色因種類(lèi)不同而異。椰子的種子很大，油菜、芝麻的種子較小，而、馬齒莧、蘭科植物的種子則更小。蠶豆、菜豆為腎臟形，豌豆、龍眼為圓球狀；花生為橢圓形；瓜類(lèi)的種子多為扁圓形。顏色以褐色和黑色較多，但也有其他顏色，例如豆類(lèi)種子就有黑、紅、綠、黃、白等色。種子表面有的光滑發(fā)亮、也有的暗淡或粗糙。造成表面粗糙的原因是由于表面有穴、溝、網(wǎng)紋、條紋、突起、棱脊等雕紋的結(jié)果。有些還可看到種子成熟后自珠柄上脫落留下的斑痕棗種臍和珠孔。有的種子還具有翅、冠毛、刺、芒和毛等附屬物，這些都有助于種子的傳播。種子體積的大小差異很大，一個(gè)帶著內(nèi)果皮的椰子種子，可以達(dá)幾千克重，而藥用植物馬齒莧種子的千粒重只有0.13克，寄生的高等植物列當(dāng)種子更小，千粒重僅在0.0029-0.0049克之間。